Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp3Q7TNH6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms