Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms