Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb3Q6XAS4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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