Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
GcsamQ6RFH4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms