Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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