Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tpm4Q6IRU2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tpm4Q6IRU2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms