Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms