Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Sdc3Q64519 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Sdc3Q64519 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Sdc3Q64519 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Sdc3Q64519 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Sdc3Q64519 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Sdc3Q64519 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc3Q64519 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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