Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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PtprjQ64455 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PtprjQ64455 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PtprjQ64455 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PtprjQ64455 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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PtprjQ64455 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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PtprjQ64455 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PtprjQ64455 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprjQ64455 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms