Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf1Q64213 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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