Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sall3Q62255 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sall3Q62255 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sall3Q62255 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sall3Q62255 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sall3Q62255 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sall3Q62255 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sall3Q62255 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sall3Q62255 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sall3Q62255 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms