Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms