Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna11Q61716 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna11Q61716 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms