Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp7Q60973 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms