Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms