Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 4854.4 ms