Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma5Q5DTT8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma5Q5DTT8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms