Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp235Q499D5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms