Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snx25Q3ZT31 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snx25Q3ZT31 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snx25Q3ZT31 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snx25Q3ZT31 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Snx25Q3ZT31 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Snx25Q3ZT31 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Snx25Q3ZT31 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Snx25Q3ZT31 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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