Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ulk4Q3V129 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms