Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrfip1Q3UZ39 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms