Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms