Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrrc58Q3UGP9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms