Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LbrQ3U9G9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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