Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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