Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ctdnep1Q3TP92 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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