Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccbe1Q3MI99 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccbe1Q3MI99 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms