Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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