Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms