Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms