Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MestQ07646 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MestQ07646 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MestQ07646 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms