Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NrepQ07475 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms