Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms