Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sox9Q04887 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms