Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb5Q02739 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb5Q02739 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb5Q02739 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb5Q02739 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms