Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax5Q02650 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms