Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms