Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms