Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms