Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mc1rQ01727 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms