Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col1a2Q01149 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms