Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelpQ01102 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelpQ01102 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelpQ01102 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms