Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms