Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms