Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp9bP98195 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp9bP98195 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms