Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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