Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gbx1P82976 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gbx1P82976 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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