Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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