Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp2P63044 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms