Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps11P62281 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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